El tercer paso del proceso integral de reingeniería de la EETC MT fue la construcción de una estrategia de gestión del cambio organizacional capaz de garantizar la articulación técnica especializada, administrativa, de gestión y de política, sin afectar el servicio.

Se diseñó una guía de cadenas de valor para moderar macroprocesos y flujos de decisión y se construyeron instrumentos para facilitar a todos los funcionarios, el entendimiento de la nueva estructura. La herramienta les ofrece información sobre cada dependencia y los niveles de articulación por cadena de valor, por actividad y hasta por niveles de relacionamiento interinstitucional, útiles para la toma de decisiones y auto evaluación respecto a movimientos profesionales entre dependencias